Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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NEDD8Q15843 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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