Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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BRD3Q15059 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRD3Q15059 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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