Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC7Q15024 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC7Q15024 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms