Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GBX1Q14549 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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GBX1Q14549 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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GBX1Q14549 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GBX1Q14549 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GBX1Q14549 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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GBX1Q14549 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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