Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM25Q14258 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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