Protein–RNA interactions for Protein: Q14257

RCN2, Reticulocalbin-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN2Q14257 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RCN2Q14257 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RCN2Q14257 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms