Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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