Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H3Q13889 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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