Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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