Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKP1Q13835 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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