Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CUL4AQ13619 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL4AQ13619 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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