Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMED1Q13445 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TMED1Q13445 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMED1Q13445 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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