Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PMS2P3Q13401 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PMS2P3Q13401 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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