Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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SKP2Q13309 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKP2Q13309 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKP2Q13309 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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