Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ERCC8Q13216 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERCC8Q13216 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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