Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX3Q13185 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX3Q13185 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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