Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHD3Q12873 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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