Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSRP1Q08945 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms