Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP3CAQ08209 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP3CAQ08209 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms