Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TGM3Q08188 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TGM3Q08188 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms