Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ID3Q02535 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms