Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SP4Q02446 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SP4Q02446 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms