Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HSF1Q00613 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms