Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CBX1P83916 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX1P83916 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CBX1P83916 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CBX1P83916 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CBX1P83916 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms