Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SIM1P81133 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SIM1P81133 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SIM1P81133 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SIM1P81133 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SIM1P81133 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms