Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPNP63162 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPNP63162 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms