Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR2LP62875 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2LP62875 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2LP62875 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2LP62875 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR2LP62875 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms