Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11AP62491 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms