Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LMO4P61968 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LMO4P61968 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LMO4P61968 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms