Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTBP60709 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTBP60709 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTBP60709 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms