Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVFC1-1P60608 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ERVFC1-1P60608 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms