Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP4CP60510 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms