Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX3P56589 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX3P56589 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX3P56589 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX3P56589 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PEX3P56589 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms