Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAV3P56539 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAV3P56539 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAV3P56539 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAV3P56539 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms