Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACLYP53396 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACLYP53396 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACLYP53396 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACLYP53396 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACLYP53396 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACLYP53396 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms