Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NDST1P52848 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NDST1P52848 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDST1P52848 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDST1P52848 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDST1P52848 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms