Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A2P52657 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms