Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DAP3P51398 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DAP3P51398 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DAP3P51398 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DAP3P51398 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DAP3P51398 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms