Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSK3BP49841 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GSK3BP49841 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms