Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CSNK1EP49674 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms