Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUFMP49411 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUFMP49411 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUFMP49411 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUFMP49411 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUFMP49411 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUFMP49411 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUFMP49411 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TUFMP49411 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUFMP49411 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms