Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IGHMBP2P38935 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGHMBP2P38935 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms