Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSPA9P38646 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSPA9P38646 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HSPA9P38646 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSPA9P38646 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSPA9P38646 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSPA9P38646 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms