Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPARGP37231 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPARGP37231 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARGP37231 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARGP37231 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARGP37231 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARGP37231 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPARGP37231 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPARGP37231 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPARGP37231 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms