Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	FPR1	YNL135C	345 nt		3.06	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	VPS35	YJL154C	2835 nt		3.06	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	DFG16	YOR030W	1860 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YGL069C	YGL069C	465 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	SDH2	YLL041C	801 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YLR154W-E	YLR154W-E	204 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	SMA2	YML066C	1110 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	RIM20	YOR275C	1986 nt		3.05	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	HRD3	YLR207W	2502 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	REC8	YPR007C	2043 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YFH1	YDL120W	525 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YHL042W	YHL042W	453 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	ABF2	YMR072W	552 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	DUG2	YBR281C	2637 nt		3.04	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	TOF2	YKR010C	2316 nt		3.03	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.03	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	MCD1	YDL003W	1701 nt		3.03	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	SNC2	YOR327C	348 nt		3.03	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	COG8	YML071C	1824 nt		3.03	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	PAN3	YKL025C	2040 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	RGA2	YDR379W	3030 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	FIR1	YER032W	2631 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YGL041C	YGL041C	204 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	snR42	snR42	351 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	KEL2	YGR238C	2649 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	ALK2	YBL009W	2031 nt		3.02	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	HCS1	YKL017C	2052 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	FMP16	YDR070C	282 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YML037C	YML037C	1023 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YOL155W-A	YOL155W-A	135 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	VMA9	YCL005W-A	222 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	SNU114	YKL173W	3027 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	BFA1	YJR053W	1725 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	GCV2	YMR189W	3105 nt		3.01	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	SMD1	YGR074W	441 nt		3	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	RPL38	YLR325C	237 nt		3	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	RRP12	YPL012W	3687 nt		3	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	FUN30	YAL019W	3396 nt		3	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	SDC25	YLL016W	3147 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	TMN3	YER113C	2121 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	SOK2	YMR016C	2358 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	NPC2	YDL046W	522 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	HHT1	YBR010W	411 nt		2.99	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	CSR2	YPR030W	3366 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YHR080C	YHR080C	4038 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	ECM21	YBL101C	3354 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	DYN2	YDR424C	279 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	PRE4	YFR050C	801 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YLR294C	YLR294C	330 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YMR307C-A	YMR307C-A	195 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YNL198C	YNL198C	303 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	CRS5	YOR031W	210 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YBR064W	YBR064W	429 nt		2.98	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YCK3	YER123W	1575 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	NOP10	YHR072W-A	177 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	YPR063C	YPR063C	423 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	HDA3	YPR179C	1968 nt		2.97	□□□□□ -1.93
LYP1	P32487	UTP14	YML093W	2700 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	RAX2	YLR084C	3663 nt		2.96	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	APQ12	YIL040W	417 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	RPA34	YJL148W	702 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YAL042C-A	YAL042C-A	378 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	PCC1	YKR095W-A	267 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YML007C-A	YML007C-A	111 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	PEX8	YGR077C	1770 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YSP2	YDR326C	4317 nt		2.95	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	SSN2	YDR443C	4263 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	VPS16	YPL045W	2397 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YPP1	YGR198W	2454 nt		2.94	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	GEA1	YJR031C	4227 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	NUT2	YPR168W	474 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YBR224W	YBR224W	516 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	TAE2	YPL009C	3117 nt		2.93	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	KAP123	YER110C	3342 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	SUL1	YBR294W	2580 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YLL032C	YLL032C	2478 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	snR55	snR55	98 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	ACB1	YGR037C	264 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	PHD1	YKL043W	1101 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YCL023C	YCL023C	348 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YGR250C	YGR250C	2346 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	SPO14	YKR031C	5052 nt		2.92	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	SEF1	YBL066C	3447 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	snR60	snR60	104 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YOR333C	YOR333C	417 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YBR277C	YBR277C	402 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	YBR184W	YBR184W	1572 nt		2.91	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	RIC1	YLR039C	3171 nt		2.9	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	SCW11	YGL028C	1629 nt		2.9	□□□□□ -1.94
LYP1	P32487	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.9	□□□□□ -1.95
LYP1	P32487	YDR426C	YDR426C	378 nt		2.9	□□□□□ -1.95

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