Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXC8P31273 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXC8P31273 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms