Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXA9P31269 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXA9P31269 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms