Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA5P30532 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA5P30532 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms