Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5DP30049 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5DP30049 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms