Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PEX2P28328 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PEX2P28328 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PEX2P28328 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms